Pyrimidin ist eine aromatische heterocyclische organische Verbindung ähnlich zu Pyridin. Eines der drei Diazine (sechsgliedrige Heterocyclen mit zwei Stickstoffatomen im Ring), es hat die Stickstoffatome an den Positionen 1 und 3 im Ring.:250 Die anderen Diazine sind Pyrazin (Stickstoffatome an den 1- und 4-Positionen) und Pyridazin (Stickstoffatome an den Positionen 1 und 2). In Nukleinsäuren sind drei Arten von Nukleobasen Pyrimidin-Derivate: Cytosin (C), Thymin (T) und Uracil (U).

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